Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capns1O88456 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms