Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms