Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm10509O88255 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Gm10509O88255 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Gm10509O88255 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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