Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx2O70340 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx2O70340 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms