Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkbO70126 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkbO70126 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkbO70126 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkbO70126 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AurkbO70126 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms