Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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BckdkO55028 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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BckdkO55028 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdkO55028 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdkO55028 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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BckdkO55028 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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BckdkO55028 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdkO55028 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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BckdkO55028 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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BckdkO55028 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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BckdkO55028 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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BckdkO55028 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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BckdkO55028 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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BckdkO55028 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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BckdkO55028 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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BckdkO55028 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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