Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlkO54988 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlkO54988 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlkO54988 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlkO54988 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SlkO54988 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlkO54988 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlkO54988 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlkO54988 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlkO54988 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlkO54988 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlkO54988 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlkO54988 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SlkO54988 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlkO54988 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlkO54988 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlkO54988 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SlkO54988 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlkO54988 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlkO54988 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SlkO54988 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlkO54988 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlkO54988 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlkO54988 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlkO54988 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlkO54988 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlkO54988 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlkO54988 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlkO54988 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlkO54988 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlkO54988 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SlkO54988 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlkO54988 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlkO54988 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlkO54988 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlkO54988 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlkO54988 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlkO54988 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlkO54988 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlkO54988 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlkO54988 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlkO54988 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlkO54988 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SlkO54988 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlkO54988 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SlkO54988 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlkO54988 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlkO54988 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlkO54988 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlkO54988 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SlkO54988 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SlkO54988 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SlkO54988 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SlkO54988 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SlkO54988 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlkO54988 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms