Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms