Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DffaO54786 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffaO54786 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffaO54786 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffaO54786 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffaO54786 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffaO54786 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffaO54786 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffaO54786 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffaO54786 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DffaO54786 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DffaO54786 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DffaO54786 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DffaO54786 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DffaO54786 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DffaO54786 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DffaO54786 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DffaO54786 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DffaO54786 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DffaO54786 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DffaO54786 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffaO54786 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffaO54786 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffaO54786 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms