Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ccl25O35903 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ccl25O35903 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ccl25O35903 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ccl25O35903 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Ccl25O35903 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Ccl25O35903 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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