Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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