Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Klf12O35738 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms