Protein–RNA interactions for Protein: O35716

Socs1, Suppressor of cytokine signaling 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs1O35716 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Socs1O35716 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Socs1O35716 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms