Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms