Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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