Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms