Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms