Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccrl2O35457 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccrl2O35457 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccrl2O35457 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccrl2O35457 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccrl2O35457 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccrl2O35457 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccrl2O35457 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccrl2O35457 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccrl2O35457 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccrl2O35457 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccrl2O35457 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccrl2O35457 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccrl2O35457 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccrl2O35457 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms