Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms