Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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