Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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