Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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