Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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