Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms