Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Gm20918J3QN17 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
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Gm20918J3QN17 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20918J3QN17 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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