Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms