Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20873J3QMQ9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms