Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gm20834J3QM72 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gm20834J3QM72 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gm20834J3QM72 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm20834J3QM72 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm20834J3QM72 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm20834J3QM72 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm20834J3QM72 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm20834J3QM72 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20834J3QM72 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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