Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms