Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms