Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Zfp408H7BX78 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Zfp408H7BX78 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Zfp408H7BX78 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Zfp408H7BX78 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Zfp408H7BX78 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Zfp408H7BX78 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Zfp408H7BX78 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Zfp408H7BX78 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Zfp408H7BX78 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Zfp408H7BX78 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Zfp408H7BX78 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Zfp408H7BX78 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms