Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms