Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arid4aF8VPQ2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms