Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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Gm28038F7BCN9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Gm28038F7BCN9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Gm28038F7BCN9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm28038F7BCN9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm28038F7BCN9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm28038F7BCN9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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