Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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