Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms