Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms