Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms