Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm17555F6U8B9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm17555F6U8B9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm17555F6U8B9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm17555F6U8B9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm17555F6U8B9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm17555F6U8B9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm17555F6U8B9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm17555F6U8B9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm17555F6U8B9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm17555F6U8B9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm17555F6U8B9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm17555F6U8B9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17555F6U8B9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17555F6U8B9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17555F6U8B9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17555F6U8B9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17555F6U8B9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17555F6U8B9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17555F6U8B9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17555F6U8B9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17555F6U8B9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17555F6U8B9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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