Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28305F6U473 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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