Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC067074F6RXI4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms