Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nolc1E9Q5C9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms