Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip11E9Q512 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trip11E9Q512 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trip11E9Q512 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trip11E9Q512 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trip11E9Q512 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trip11E9Q512 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trip11E9Q512 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trip11E9Q512 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip11E9Q512 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip11E9Q512 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip11E9Q512 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip11E9Q512 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip11E9Q512 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip11E9Q512 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms