Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ccdc71lE9Q4T4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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