Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
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ApobE9Q414 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
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ApobE9Q414 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
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ApobE9Q414 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
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ApobE9Q414 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
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ApobE9Q414 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
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ApobE9Q414 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
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ApobE9Q414 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
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