Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Zfp558E9Q1J0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Zfp558E9Q1J0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Zfp558E9Q1J0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Zfp558E9Q1J0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Zfp558E9Q1J0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Zfp558E9Q1J0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Zfp558E9Q1J0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Zfp558E9Q1J0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Zfp558E9Q1J0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Zfp558E9Q1J0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Zfp558E9Q1J0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Zfp558E9Q1J0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Zfp558E9Q1J0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Zfp558E9Q1J0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Zfp558E9Q1J0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Zfp558E9Q1J0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Zfp558E9Q1J0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Zfp558E9Q1J0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Zfp558E9Q1J0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Zfp558E9Q1J0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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