Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcom1E9PZ54 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms