Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Srp54bE9PXC0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Srp54bE9PXC0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Srp54bE9PXC0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54bE9PXC0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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