Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms