Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3bE9PUL3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms